패스웨이(Pathway)의 개념과 분석

패스웨이(Pathway)

1. pathway란?

: 단백질, 유전자 등의 생체 요소 간의 상호작용을 설명하는 생물학적 심층 지식

* 생합성 경로로 pathway를 번역할 수 있으나, 대부분 사용하지 않는다. 

 

2. 패스웨이 분석

패스웨이 분석은 유전자와 단백질 등을 기반으로 질병과 관련된 패스웨이를 식별한다. 이를 통해, 어떤 현상으로 질병을 일으키는지에 대해 해석할 수 있어 bioinformatics 관련 연구를 하는데 사용된다.

 

3. KEGG

KEGG는 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes의 약자로, pathway map의 모음이다. 분자 간의 상호작용, 반응 및 관계 네트워크에 대한 여러 종류의 map이 있다. Bioinformatics 분야에서 pathway 분석에서 자주 인용되는 DB이다.

 

KEGG를 통해 다음과 같은 정보를 얻을 수 있다.

• 생화학적 정보들 간의 네트워크 상호 작용
• 유전자 및 단백질 수준의 분자 단위 정보
• 생체계에 영향을 주는 질병 및 약물 정보
• 화학 물질 수준의 분자 단위 정보

ex. 광합성 대사의 pathway

 

KEGG에 저장된 여러 pathway map과 함께 KEGG Mapper와 Search&Color pathway 등의 웹 툴을 활용해 pathway 분석 결과를 더 시각적으로 표현할 수 있다.

 

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- 24.03.14 LAB meeting -

랩 미팅 중 생소했던 개념을 정리한 글입니다.