본문 바로가기

예바의 LAB19

[논문 발표] Differential Transformer 2024.11.15논문 "Differential Transformer"을 읽고 랩미팅 시간에 발표한 자료입니다. 2024. 11. 16.
[프로젝트] Samsung AI Challenge: MLFF Fields 2024 Samsung AI Challenge: Machine Learning Force Fields 2024 회고록 (2024.08.05 ~ 2024.09.13)Dream 챌린지에 이어 바로 시작하게 된 Samsung AI Challenge: Machine Learning Force Fields이다. 이 챌린지에서 요구하는 Task는 입력된 원자 구조로부터 시스템의 에너지 및 힘을 예측하면서 예측값에 대한 uncertainty를 모두 출력하는 것이다. 우리에게 원자 구조에 대한 정보를 xyz 파일 포맷으로 주어졌으며 모델을 처음부터 설계하기보다는 기존의 MLFF 모델을 변형하는 방향으로 챌린지를 진행하였다. 프로젝트 내의 역할#1. MLFF(Machine Learning Force Fields) 모델과 데이터셋.. 2024. 9. 18.
[프로젝트] Dream Olfactory Challenge 2024 Dream Olfactory Challenge 2024 회고록 (2024.05.01 ~ 2024.08.02)나의 첫 인공지능 프로젝트로, Synapse에서 진행하는 Dream Olfactory Challenge이다. 해당 챌린지에서 요구한 Task는 2개의 분자 혼합물 간의 냄새 유사도 예측이다. 우리에게 주어진 데이터로는, Mixture의 구성 요소인 CID 리스트와, 2개의 Mixture 쌍과 유사도 수치가 있다. 최종적으로 제출한 모델의 아키텍처는 아래와 같다. 프로젝트 내의 역할초기에 전체적인 모델의 아키텍처를 구상할 때, 화학 분자와 후각 수용체 단백질로 2가지 컴포넌트로 이루어져 있었다. 아무래도 후각을 예측하기 위해서 Mixture를 구성하는 화학 성분도 중요하지만, 이에 반응하는 사람의 후.. 2024. 9. 1.
[CAUTION] 코드 수정 시, 기본 코드 내의 식별자 및 흐름 확인하기 2024.08.19코드 수정 시, 기본 코드 내의 식별자 및 흐름 확인하기 ❌ 문제의 코드 ❌파일 내에서 key-value 형태의 메타 데이터를 추가하기 위해 기존 모델의 코드에 메타 데이터를 개별적으로 파싱하는 부분을 추가하였다. 아무 생각 없이 key-value이니 식별자를 key로 두었는데, 이것이 문제가 되었다. 가장 바깥 쪽에 있는 for문에서 key를 사용하는데, 가장 안쪽에서도 동일한 key를 사용하여 key가 "train"이 되지 못하여 save_normalization_statistic 함수를 실행하지 못하였다. # Start preprocessing for key, xyzfile, lmdbfile in key_xyz_lmdb_list: trajectory = ase.i.. 2024. 8. 20.